کتابخانه تخصصی مرکز پزشکی آموزشی درمانی کودکان حضرت علی اصغر (ع) در سال ۱۳۴۳، هم زمان با تأسیس این مرکز آغاز به‌کار کرده است. مساحت کتابخانه در حدود ۸۰ متر مربع است و شامل دو بخش مجزای سالن مطالعه و مخزن است. کتابخانه مرکز، هم اکنون در طبقه دوم ساختمان اصلی واقع شده است و به ارائه خدمات اطلاع رسانی به پزشکان و دانشجویان پزشکی مراجعه کننده می پردازد. منابع کتابخانه متناسب با رشته‌ها و گرایش‌های تخصص و فوق‌تخصص موجود در این مرکز فراهم آوری شده است. کتابخانه دارای بیش از 1100 عنوان کتاب لاتین، ۸۰۰ عنوان کتاب فارسی و بیش از ۲۰۰ عنوان کتاب الکترونیکی در قالب PDF است که در دسترس مراجعه کنندگان این کتابخانه قرار دارد. لازم به ذکر است در بیشتر موارد کتاب‌هایی که مراجعین مایلند در قالب PDF نیز داشته باشند در اسرع وقت تهیه و در اختیار آنها قرار می‌گیرد. در مورد مجلات الکترونیک نیز در صورت تمایل با ذکر عنوان مجله تمام مجله و یا تعدادی از مقالات مجله توسط کتابدار مربوطه بازیابی می‌شود و در اختیار قرار داده می‌شود. امکان دسترسی به کلیه پایگاه‌های اطلاعاتی تحت پوشش وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی از طریق وب سایت کتابخانه فراهم شده است. این دسترسی از فضای داخل بیمارستان و با کامپیوترهای مرکز به راحتی و بدون نیاز به کدکاربری و کلمه عبور فراهم می‌شود. کاربران برای دسترسی خارج از محیط دانشگاه و بیمارستان نیز می‌توانند از سرویس VPN دانشگاه استفاده نمایند. در حال حاضر تمامی اعضای هیأت علمی، دستیاران تخصصی و دستیاران فوق تخصصی امکان استفاده از سرویس VPN را دارند.